Die Lösung:
Das Menüsystem kann zurückgesetzt werden, indem Sie einen Schlüssel in der Registrierungsdatenbank (Registry) löschen:
regedit.exe
ein und klicken Sie OKHKEY_CURRENT_USER\Software\GRAHL\PDFAnnotator\9.0\Toolbars
HKEY_CURRENT_USER\Software\GRAHL\PDFAnnotator\8.0\Toolbars